Центр навчально-практичної підготовки, професійної та дуальної освіти УкрДУЗТ має тісні зв’язки зі структурними та виробничими підрозділами Регіональної філії «Південна залізниця» АТ «Укрзалізниця», серед яких: електровозне депо «Харків-Головне» ТЧ-2, локомотивне депо «Основа» ТЧ-3, Моторвагонне депо «Харків» (РПЧ-1», вагонне депо ВЧД-3 (ст. Основа), вагонні дільниці ВЧ-1 (Харків), ВЧ-3 (Суми), ВЧ-4 (Полтава), вагонне депо ВЧД-6 та вантажне депо ВЧД-2 ст. Харків-Сортувальний, вокзали Харків-Пасажирський, Харків-Левада, Харків-Сортувальний, Харків – Балашовський, дільниці зв’язку ШЧ-2 (Харків) та ШЧ-5 (Основа), дільниці колії ПЧ-3 (Харків) та ПЧ-7 (Основа), дистанції електропостачання ЕЧ-2 (Харків) та ЕЧ-7 (Основа), дистанції сигналізації та зв’язку ШЧ-2 (Харків) та ШЧ-5 (Основа) тощо.
Крім того, ЦНПП взаємодіє зі структурними підрозділами всіх філій та регіональних філій АТ «Укрзалізниця», департаментами АТ «Укрзалізниця», метрополітенами України (Харківським, Київським, Дніпровським), підприємствами промислового залізницчного транспорту, федераціями роботодавців України за різними галузями, Галузевою експертною радою з галузі знань 27 «Транспорт» Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти, регіональними центрами зайнятості та іншими підприємствами, установами і організації різних форм власності й підпорядкування.
Виробниче навчання проводяться за участю співробітників структурних підрозділів Південної залізниці, Пасажирської компанії АТ “Укрзалізниця”, Харківського професійного ліцею залізничного транспорту та інших стейкголдерів.